MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori Shi417 chromosome

Total Repeats: 4001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017739	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017739	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017739	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017739	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017739	ATGC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017739	TGG	2	6	4293	4298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017739	GTG	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017739	ACC	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017739	GGT	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017739	A	7	7	4575	4581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017739	T	8	8	4595	4602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017739	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017739	GAAAC	2	10	4645	4654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017739	TAAA	2	8	4685	4692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017739	A	7	7	4690	4696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017739	CA	3	6	4905	4910	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017739	G	6	6	4966	4971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017739	TAC	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017739	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017739	A	7	7	5113	5119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017739	A	6	6	5214	5219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017739	TAAAA	2	10	5249	5258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017739	ATAAA	2	10	5268	5277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017739	T	6	6	5279	5284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017739	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017739	AAT	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017739	ATAA	2	8	7478	7485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017739	TAA	2	6	7568	7573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017739	ATT	2	6	7587	7592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017739	CAA	2	6	7655	7660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017739	ATTC	2	8	7681	7688	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017739	GAA	2	6	7716	7721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017739	GCTTT	2	10	11399	11408	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017739	T	6	6	11406	11411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017739	T	7	7	11468	11474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017739	ATA	2	6	11478	11483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017739	TTAA	2	8	11497	11504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017739	A	6	6	14444	14449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017739	CA	3	6	14491	14496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017739	CTG	2	6	14512	14517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017739	A	6	6	14647	14652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017739	A	6	6	16086	16091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017739	AAACAC	2	12	16121	16132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017739	ATCA	2	8	20530	20537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017739	CTCC	2	8	20593	20600	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_017739	AAG	2	6	20814	20819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017739	CTT	2	6	22951	22956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017739	GTAT	2	8	22986	22993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017739	ATACC	2	10	23001	23010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017739	ATTA	2	8	23053	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017739	A	14	14	23078	23091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017739	GTT	2	6	23153	23158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017739	AG	3	6	23260	23265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017739	A	6	6	24768	24773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017739	T	6	6	24803	24808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017739	A	6	6	24846	24851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017739	TA	3	6	24865	24870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017739	T	6	6	26205	26210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017739	A	6	6	26237	26242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017739	T	6	6	27734	27739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017739	TCA	2	6	27786	27791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017739	T	6	6	27834	27839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017739	GGTT	2	8	27922	27929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017739	AGC	2	6	28355	28360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017739	T	8	8	33604	33611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017739	TTA	2	6	33613	33618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017739	A	7	7	33663	33669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017739	TAA	2	6	36572	36577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017739	A	6	6	36582	36587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017739	AGT	2	6	40172	40177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017739	ATT	2	6	40190	40195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017739	T	6	6	40257	40262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017739	ATC	2	6	40263	40268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017739	T	7	7	40277	40283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017739	TAGACT	3	18	40342	40359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017739	AG	3	6	40386	40391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017739	TAA	2	6	46499	46504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017739	ATC	2	6	46515	46520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017739	TTA	2	6	46558	46563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017739	T	7	7	46612	46618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017739	T	6	6	47700	47705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017739	TTTA	2	8	53005	53012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017739	GCGG	2	8	53043	53050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017739	T	6	6	53076	53081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017739	TAAT	2	8	53105	53112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017739	TTGT	2	8	53183	53190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017739	TAA	3	9	53211	53219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017739	ATTAT	2	10	53220	53229	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017739	TTAAA	2	10	53274	53283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017739	ACAAA	2	10	53304	53313	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017739	G	7	7	53556	53562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017739	T	6	6	53836	53841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017739	AAAGA	2	10	53885	53894	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017739	AAG	2	6	53915	53920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017739	AGAA	2	8	53961	53968	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017739	AGATAA	2	12	53982	53993	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017739	CTGA	2	8	54016	54023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017739	A	7	7	54023	54029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017739	CTAA	2	8	54100	54107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017739	A	6	6	54152	54157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017739	ACTG	2	8	54162	54169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017739	A	7	7	54170	54176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017739	GAT	2	6	54187	54192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017739	TTA	2	6	54202	54207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017739	A	6	6	54249	54254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017739	AAAATC	2	12	54299	54310	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017739	A	6	6	54320	54325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017739	ACTG	2	8	54330	54337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017739	A	7	7	54338	54344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017739	A	6	6	54460	54465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017739	TAG	2	6	55739	55744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017739	GAA	2	6	55789	55794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017739	A	6	6	55810	55815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017739	AGA	3	9	55824	55832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017739	CAAG	2	8	55845	55852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017739	TAA	2	6	55878	55883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017739	CTT	2	6	55889	55894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017739	TGA	2	6	55908	55913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017739	A	6	6	55973	55978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017739	GATGTG	2	12	56002	56013	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017739	ATA	2	6	56051	56056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017739	AAAG	2	8	56143	56150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017739	AGA	2	6	56196	56201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017739	TGCT	2	8	56314	56321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017739	CT	3	6	56320	56325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017739	TGG	2	6	56328	56333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017739	A	6	6	56355	56360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017739	TAG	2	6	56378	56383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017739	ACC	2	6	56429	56434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017739	T	7	7	56527	56533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017739	AGG	2	6	56588	56593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017739	CAA	2	6	56673	56678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017739	TATCC	2	10	56711	56720	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017739	A	6	6	56747	56752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017739	AG	4	8	56755	56762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017739	GAGC	3	12	56846	56857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017739	TTA	2	6	56928	56933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017739	GAC	2	6	56958	56963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017739	A	6	6	56987	56992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017739	TTG	2	6	57076	57081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017739	GAAA	2	8	57117	57124	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017739	TGA	2	6	57162	57167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017739	GC	3	6	57201	57206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017739	T	6	6	57242	57247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017739	AGA	2	6	57281	57286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017739	AGAT	2	8	57418	57425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017739	CTT	2	6	57440	57445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017739	AGG	2	6	57512	57517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017739	GAT	2	6	57606	57611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017739	CATT	2	8	57616	57623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017739	G	7	7	57700	57706	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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